Whipple病患者宜吃不饱和性脂肪酸含量高、饱和性脂肪酸含量低和温热性的食物，忌吃高钙质、高胆固醇和性味寒凉性的食物。服用抗生素的患者可多吃含维生素B族的食物，如黄豆、瘦肉、绿叶蔬菜等，缓解服药引起的不良反应。大多数水果(如苹果，杏，樱桃，葡萄，橙子，橘子，猕猴桃等)含有大量的柠檬酸，苹果酸，酒石酸等酸味成分，对抗生素药效的影响越大，口服抗生素后2小时内尽量不吃水果，也不要喝果汁。
