沙眼衣原体感染由A、B、C或Ba抗原型沙眼衣原体感染引起所致 。 衣原体包括沙眼衣原体、鹦鹉热衣原体和肺炎衣原体3种。沙眼衣原衣原体又分为沙眼、性病淋巴肉芽肿（LGV）和鼠生物变种3个生物变种。沙眼衣原衣原体生物变种有A～K18个血清型，其中A、B、Ba、C引起沙眼，D～K型引起泌尿生殖道感染，如包涵体结膜炎、非淋菌性尿道炎、宫颈炎、输卵管炎等。
