新生儿败血症早期症状不典型，极容易忽视，严重时则伴有脑膜炎等严重并发症，死亡率极高。其并发症主要有一下几种：
1.化脓性脑膜炎 新生儿败血症最易并发化脓性脑膜炎，有时神经系统症状并不明显，但已并发此症，因此要提高警惕，及早作脑脊液检查。
2.肺炎或肺脓肿 其次易发生肺炎或肺脓肿，出现呼吸系统症状。
3.迁移性病灶 如蜂窝组织炎，骨髓炎，肾盂肾炎也偶可发生。
4.多脏器功能障碍综合征(multiple organs dysfunction syndrome，MODS) 感染扩散的严重结果往往为MODS。
