生殖道肿瘤的病因至今仍不明了。流行病学的资料研究认为与如下因素有关。
1、慢性刺激：原发性阴道鳞癌常发生于后窟窿，认为可能与子宫脱垂病人长期使用子宫托、阴道白斑或局部炎症刺激有关。
2、盆腔放射治疗：原发性阴道癌约有20％以上病人曾有盆腔放射治疗史。一般认为宫颈癌放射治疗后10～40年可发生阴道细胞结构不良或阴道癌。40岁以下盆腔放射治疗病的妇女，阴道癌的发生率较高。
3、病毒感染：人类乳头状瘤，尤其是16和18型可能被认为阴道恶性肿瘤的启动因子。
4、免疫抑制：凡先天性或后天性获得性和人工性的免疫抑制病人，癌瘤的发生率较高。阴道癌也不例外，其发生率在免疫抑制病人较高。
5、雌激素缺乏：阴道鳞癌好发于年迈的妇女，可能与绝经后雌激素水平低下，导致了阴道粘膜上皮萎缩，为致癌因子创造了有利条件有关。
6、近来认为阴道透明细胞腺癌与内外源性雌激素有关。
7、据推测阴道内胚窦瘤可能是在生殖细胞迁移的决定期缺乏胚胎的组织导体，结果致生殖细胞错位进入阴道上段所致。
