引起皮肤脓肿的细菌是受累部位的皮肤所原有的。其最常见的需氧菌是金黄色葡萄球菌，而厌氧菌是消化球菌属和丙酸杆菌属。会阴部（腹股沟、阴道、臀部和直肠周）的脓肿，常为由厌氧菌单独所致或由需氧菌联合所致。其中，α-溶血性和非溶血性链球菌是最常见的需氧菌；消化球菌属、消化链球菌属、乳酸杆菌属、类杆菌属和梭形杆菌属是最主要的厌氧菌。
