自从使用抗菌素以后，淋病合并症前列腺炎的并发症已大为减少，出现并发症，多数是由于急性期未得到及时有效的治疗，或者患者体弱，抵抗力低下。经反复发作可导致尿道狭窄、输精管狭窄或梗阻，继发不育。女性严重者可产生腹膜刺激征和全身症状。反复发作可致输卵管的狭窄或闭塞，导致宫外孕和不孕症。
