过敏性肉芽性前列腺炎是一种全身性过敏反应疾病，临床上少见。由于过敏性肉芽性前列腺炎是一种全身性疾病，需要早期诊断并进行大剂量的激素治疗，所以必须与其他伴有嗜酸性粒细胞的肉芽肿性前列腺炎相鉴别。
多数过敏性肉芽性前列腺炎患者在诊断为本病时都同时伴有哮喘或其他的过敏反应性疾病，且大部分患者末梢血中嗜酸性粒细胞的比例增高。一些患者哮喘症状的轻重与尿道梗阻症状严重程度呈同步波动，患者还可同时伴有其他器官的系统性肉芽肿。
组织学上，过敏性肉芽肿性前列腺炎患者的前列腺组织中，有多发的、体积较小、椭圆形、中心呈渐进性坏死的肉芽肿，周围有大量的嗜酸性粒细胞浸润。在一般情况下，过敏性肉芽肿性前列腺炎与手术后的前列腺肉芽肿相比，大小较为一致，形状比较规则，嗜酸性粒细胞也更多。但个别情况下，这些特征并不明显。这时患者过往有无经尿道前列腺电切手术史和肉芽肿周围局限性的嗜酸性粒细胞，对于诊断术后前列腺肉芽肿更为重要。此外还应该鉴别伴有较多嗜酸性粒细胞的非特异性肉芽肿性前列腺炎。
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