病原体感染是前列腺炎的一个重要病因，前列腺炎一度被认为是一种感染性炎症。引起前列腺炎的病原体种类繁多，大多以革兰氏阴性菌为主。
革兰氏阴性菌
引起细菌性前列腺炎的病原体在类型及发生率方面与尿路感染均十分相似，都是以革兰氏阴性菌为主要致病菌。在常规染色下，埃希氏大肠杆菌是最主要的致病菌，而变形杆菌、克雷伯杆菌、假单胞菌以及其他一些不常见的革兰氏阴性菌则较少引起前列腺炎。
革兰氏阳性菌
革兰氏阳性菌在前列腺炎的发病中的意义尚有争议。大多数学者认为，肠球菌可以引起慢性细菌性前列腺炎及经常复发的肠球菌性菌尿，而其他革兰氏阳性菌如葡萄球菌、链球菌、微球菌及类白喉菌等在前列腺炎发病中的意义不明确。
沙眼衣原体
近些年来，沙眼衣原体在前列腺炎发病中的意义也受到重视。有研究表明，尿道及前列腺液的沙眼衣原体抗原在慢性前列腺炎患者中的发现率分别为14.3和21.4，而患有前列腺痛的全部患者中没有发现阳性者。慢性前列腺炎患者血清中检测到抗衣原体抗体的比率为30.9，而前列腺痛病人仅为8.3，这些都表明，沙眼衣原体可能是引起慢性前列腺炎的病因。
大多数前列腺炎是由单一病原体感染引起的，但涉及两种及以上病原体的情况也偶有发生。
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