生殖器疱疹较易复发，其复发的诱因包括疲劳、精神紧张、外伤、月经及其它感染等等，首次复发多出现在原发性感染消退后半年至1年，一般男性较女性多见，但女性复发后的症状较男性重。
免疫疗法是利用免疫系统来治疗疾病的一种概念，例如发展抗病毒疫苗、人乳头瘤病毒、单纯疱疹病毒抗体培养等等。对于复发性生殖器疱疹来说，免疫疗法主要是应用干扰素、细胞因子等药物提高固有免疫应答及适应性免疫应答，以达到抑制和吞噬病毒的目的。
其中，干扰素是一种广谱抗病毒剂，并不直接杀伤或抑制病毒，而主要是通过细胞表面受体作用使细胞产生抗病毒蛋白，从而抑制病毒的复制；可增强自然杀伤细胞（NK细胞）、巨噬细胞和T淋巴细胞的活力；同时还能抑制蛋白质的合成，降解病毒的mRNA，从而抵抗病毒感染。
卡介菌多糖核酸则诱导T淋巴细胞增殖、活化，诱导淋巴细胞产生干扰素，从而发挥细胞免疫功能，对抑制骶神经节残留病毒的繁殖起到一定的作用。
需要注意的是，免疫疗法治疗复发性生殖器疱疹虽然有一定的作用，但临床治疗作用尚在研究之中。
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