角膜移植术分为穿透性角膜移植和板层角膜移植两大类：
板层角膜移植术，是一种部分厚度的角膜移植。手术时仅切除角膜前面的病变组织，再移植以部分厚度的透明角膜供体，修补切除区域。术后发生免疫排斥的几率较低。临床常用于治疗中浅层角膜混浊、角膜营养不良性混浊、圆锥角膜、角膜中浅层感染、角膜肿瘤等。
穿透性角膜移植术是以全层透明角膜代替全层混浊及病变角膜的方法。适应症按其手术目的可分为光学性、治疗性、成形性、美容性等方面。光学性角膜移植术常见的适应症为圆锥角膜、各种原因所致的角膜瘢痕、各种角膜营养不良、各种原因的所致的角膜内皮细胞功能衰竭。治疗性角膜移植术的主要适应症为感染性角膜疾病、眼化学伤等。穿透性角膜移植术存在免疫排斥的风险。
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