由于过敏性咽炎属于免疫系统疾病，因此，在治疗的过程当中不可简单的等同于普通病菌感染类型的咽炎，增强机体细胞免疫力，改善过敏体质，是防治过敏性咽炎的核心环节。
然而，还是有许多过敏性咽炎患者因为始发时以为是着凉或小感冒，没有引起足够重视，从而延误了治疗时机，还有部分患者反复上医院治疗，可能因为诊断失误，没有及时针对过敏症状进行施治，用药的过程当中常常与普通的支气管炎、肺炎等一并对待，这也难怪许多过敏性咽炎患者总是迁延不愈。
目前西药治疗过敏性咽炎大多是暂时控制病情，但服用太多抗生素对人体有害无益，因为滥用抗生素可能导致咽喉部正常菌群失调。别忘记，抗生素太多也有副作用，会引起细菌抗药性加强，人体免疫功能减退，致使病情反复难愈。
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