肝癌需要与下列疾病做好鉴别诊断：
1、肝硬变：病情发展缓慢，肝可不肿大或略肿大，质硬，表面较平或可有小结，边缘锐利、整齐，AFP阴性，同位素扫描及B超均能进行鉴别。
2、肝脓肿：尤其是阿米巴肝脓肿临床表现颇难与原发性肝癌鉴别，但通过反复多次超声波检查可有液平反射，血清AFP阴性，必要时作诊断性肝穿刺。
3、其他：应考虑到其他上腹部肿物，如胰腺肿瘤或囊肿、肝或腹膜结核、胃癌等，可通过病史、体征及多种检查方法进行鉴别。
4、继发性肝癌：肝脏血源丰富，全身其他系统的癌肿可经血液、淋巴液或直接蔓延而转移至肝脏，最多的是消化器官癌肿。与原发性肝癌相比，继发性肝癌症状一般较轻，发展较慢，多有原发癌灶相应的症状，除个别源于胃、胰的继发性肝癌病例外，AFP多呈阴性。故凡肝癌者都应注意检查胃肠道、呼吸系统、泌尿系统、乳腺等，以确定或排除转移性肝癌，以利于治疗。
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