遗传咨询有助于预防发生多囊肾。近年由于遗传病学的深入研究，发现在16号染色体短臂上有血红蛋白α-链基因及磷酸羟乙醇磷酸酶(phosphoglycollatephosphatase)的基因。经阴道吸取绒毛膜的绒毛标本通过特殊的DNA探针(DNAprobe)进行DNA分析，对成人型多囊肾可正确做出产前诊断，从而可考虑及早终止妊娠。
过去早期诊断主要靠超声波检查，但在胎儿肾囊肿出现以前，超声波检查也无能为力。现在采用DNA探针，不但在产前可检出成人型多囊肾，且于出生后或对成人也能将成人型多囊肾与其他肾囊性病相鉴别。
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