关于两大类肺癌的主要临床、生物学及遗传学特征和区别列于表13-2
*神经内分泌标志：包括神经内分泌颗粒、l-dopa脱羧酶、神经元特异烯醇人酶、肌酸激酶（脑同工酶）、嗜铬粒蛋白等
近年来，分子生物学研究已发现，发展成浸润性肺癌需多种基因改变，可能过十种偿还，这些改变在两大类肺癌中有些相似，有些则不同。
1.染色体3p上极可能有肺癌相关的抑癌基因，因几乎100％sclc和70％-80％nsclc发现染色体3p的缺失，甚至在癌前病变中已存在。最近在染色体3p14.2区的脆性位点（fragilesilte）fra3b，鉴定出一个抑癌基因fhit（脆性组酸三合一基因），其在80％肺癌中有突变，这可能是寻致肺癌的基因变化中的最初环节。这项发现有可能解释吸烟与肺癌之间的关系：为何有的人吸烟会生肺癌，而且的人却不生，可能与该基因的易感性有关。最近有人用rt-pcr分析59例肺癌的fhitmrna,出现80％sclc及40％nsclc有fhit的rna转录物氨基常，76％的肿瘤呈现fhit等位基因缺失。另有人在32个肺癌细胞株中出现高频率的3p14.2等位基因（即fhit基因座）缺失（包括100％的sclc和88％的nsclc），在108例原发性nsclc肿瘤中45％有fhit缺失，并在nsclc患者的癌前病变中也有类似发现，但在肺腺癌中较少见。此上，在88％目前吸烟者和45％以往吸烟者组织学正常或轻度改变的支气管上皮中也发现染色体3p14的loh。利用分子分析fhit基因和fra3b内的微卫星体改变发现，80％吸烟者的肺癌中有fhit基因的loh，而在非吸烟者的肺癌中仅22％有loh（p-0.0001）。这些资料提示，fhit基因在吸烟引起肺癌的发生中起关键作用，可能是烟草中所含致癌物作用的分子革，其等位基因的缺失可能是最早的分子变化，随的才有9p(cdkn2),17p(p53)及ras等基因的变化，故3p被看作肺癌发病过程的“守门员”（gatekeeper）。
2.p53基因突变在各种类型肺癌中起关键作用，将近90％sclc细胞株和原发性肿瘤的有突变型或缺乏p53，而约有50％nsclc可检出p53异常。异常的p53表达与生存率低在统计学上呈显著性要关。在肺癌中，p53的突变可发生在整个编码区，但以进化上保守的外显子5-8区最常见。突变的种类包括：错义突变、无义突变、剪接异常及较大的缺失等，而以与吸烟致癌物有关的g-t碱基颠换（transversion）最常见，表明吸烟可能引起p53突变。在铀矿工人中与氡有关的肺癌中地以密码子259agg-atg碱基颠换多见；而在原子弹爆炸生存者发生的肺癌则以g-a碱基颠换占优势。p53的错义突变使p53蛋白质的半寿期延长达数小时导致其增加积聚，达到能被免疫组化检出的水平，免疫组化检测了现突变的p53在正常支气管黏膜为0，鳞状化生为8.3％，轻度异型增生为37.5％，中度为12.5％，重度为93.8％，原位癌为53％，提示p53突变可在支气管上皮的癌前主变中检出，发生在肺癌发生早期的显微浸润之前，可作为早期诊断的标志，这与p53突变在结肠癌、卵巢癌及甲状腺癌等发生中属晚期事件不同。最近konishi等在染色体17p13.3于p53基因（位于17p13.1）的远侧发现一个抑癌基因在肺癌的中也缺失。
3.rb基因，编码一核磷蛋白，调节细胞周期g1/s交界处的控制点。它原为儿童视同膜母细胞瘤的一种抑癌基因，以后被证明在肺癌等其他癌中也有rb突变，并伴有其野生型等位基因的缺失。在90％以上的sclc和20％-30％的nsclc中发现缺少rb蛋白质的合成或其结构的氨基常。rb介导的生长调节途径在nsclc中可通过周期素d1过度有达而失活，因周期素d1藉刺激rb被cdk4磷酸化而调节其活性。在nsclc中功能性rb水平正常而周期素d1过度表达，而在sclc中功有性rb水平降低而周期素d1减少。此后，rb介导的生长调节途径还可通过一种cdk抑制p16ink4而灭活（参见下一节）。
4.p16ink4是一处周期素依赖性激酶（cdk）的抑制物，它通过阻止cdk4/cdk6与周期素d1复合而抑制其活性。p16的编码基因是位于染色体9p21的cdkn2基因，它通过抑制cdk4/周期素d1复合物的激酶活性而调节rb的活性。cdkn2在肺癌及其他几种癌中的异常现象：它在30％-40％的nsclc中失活，但在sclc中去很少失活。失活的机制包括缺失（纯合性或伴点突变），以及因甲基化过度而下调其表达。因此，肺癌的特征是大多数sclc有rb突变，而大多数nsclc有周期素d1/cdkn2失活。另一种cdk抑制物p15的基因位于靠近cdkn2处，常与cdkn2-齐在nsclc中缺失。
5.ras基因家族（k-ras,n-ras及h-ras）可被密码子12，13，或61上的点突变所激活，并在20％-30％的nsclc（特别是腺癌）中突变，但未在sclc中发现突变。在肺腺癌中以k-ras突变为主（占90％），其中85％累及第12密码子，70％的k-ras突变为g-t颠换，由半胱氨酸（tgt）或缬氨酸（gtt）替换正常的甘氨酸（ggt），这可能是由吸烟中的多环碳氢化合物和亚硝胺引起的dna加合物损伤dna所致。k-ras突变还是nsclc各期的一个重要的负性预后因素。
6.myc基因家族的成员中，c-myc常sclc及nsclc活化，而n-及l-myc的扩增则仅在sclc中发现。myc基因在sclc中通过基因扩增而活化，它与不良预后要关。而在nsclc中，myc通过转录失调而致其蛋白过度表达，在缺乏某些生长因子时myc的过度表达会反常地导致细胞凋亡。由于癌细胞的凋亡在决定化疗疗效中起作用，它代表设计未来治疗中的一个关键性靶子。
7.由erb-b1编码的egfr在nsclc（特别是鳞癌）中较在sclc中更常发生过度表达，并可能与肿瘤的分期及分化有关。由erb-b2（her2/neu）编码的另一种受体p185，在1/3以上nsclc中高度表达，尤其是在腺癌，并与nsclc中一种内源性多药耐药性相关。
8.其他细胞遗传学变化：除上述基因变化外，细胞遗传学研究还发现许多其他染色体上的缺失，提示尚有其他抑癌基因参与肺癌的发生，包括：1p、1q、2q、5q、6p、6q、8p、8q、10q、11p（11p13、11p15）、11q、14q、17q、18q、22q、及x/y等。此外，用新的比较基因组杂交技术（cgh）曾检出10q26、16p11.2、22q12.1-13.的缺失，和1q24、3q、5p、17q及xq26的扩增。
9.基因组不稳定性：在肺癌中发现的一般性基因组不稳定性：如许多染色体的变化及等位基因不平衡的位点，其中有些特歹的抑癌基因的定位，但有些则随机发生，大多肺癌存在非整位体等。
微卫星不稳定性（msi）在肺癌中并不多见（
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