ⅲ期感染后数周至2年内约80%左右的患者出现程度不等的关节症状如关节疼痛关节炎或慢性侵蚀性滑膜炎。以膝、肘髋等大关节多发小关节周围组织亦可受累主要症状为关节疼痛及肿胀，膝关节可有少量积液常反复发作少数患者大关节的病变可变为慢性伴有软骨和骨组织的破坏
此期少数患者可有慢性神经系统损害及慢性萎缩性肢端皮炎的表现部分患者还可有精神异常表现。
眼部受损的病例，早期表现为结膜炎、后期主要表现为葡萄膜炎视神经炎、虹膜睫状体炎、角膜炎。此期一般始于病后2个月或更长时间，持续数月至数年。
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