扁平疣的发病是人类乳头瘤病毒感染所致，但与免疫功能低下和皮肤局部外伤有密切关系。由于目前所知抗病毒药对此类病毒的疗效都不佳，所以尽管治疗方法非常多，能达到75%以上疗效的并不多。这样就有可能不同医生给你选择扁平疣的治疗方法都不同。
扁平疣的治疗方法有激光或冷冻治疗，这主要适合于皮疹比较少，而且比较大的患者；对于皮损非常多，而且体积小的不能用此方法治疗。因为激光损伤会相对深，有可能在局部留下凹坑或瘢痕，所以患者应注意。至于皮损广泛的患者在选择扁平疣的治疗方法时，可以试用中药、外洗，口服一些调节免疫的药物，但儿童的皮肤较嫩，容易出现刺激反应，或留下色素沉着。
扁平疣发生在儿童的较少，应该去医院就诊，除扁平疣以外还有其它疾病如疣状表皮结构不良等。如果确诊是扁平疣，治疗起来比较困难。所以一定要有耐心，而且要避免搔抓，这样会自体接种，使得扁平疣越来越多。扁平疣的治疗方法中，中医药也有不少方法可用，以散风平肝、清热解毒、散结为治疗原则。当然具体还是按医嘱来使用。一般来说，扁平疣都能治愈，只是时间和方法问题。
扁平疣在治疗前要找专科医生诊断明确是否扁平疣，扁平疣很多人了解，但形态相类似的其它皮肤病并不一定知晓。
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