病变累及消化道，主要表现为食道炎、肠炎;累及泌尿系统者，主要表现为尿频、尿急，尿液混浊，有絮状物；也可发生心内膜炎及脑膜脑炎。
念珠菌属是正常消化道的,有时也是皮肤的常见共栖性真菌.与其他全身性真菌病不同,念珠菌病是由内源性病原引起,一般不从周围环境获得.
由念珠菌引起的感染占所有主要全身性真菌病的80%.如今,念珠菌已成为血流感染最常见的第4位病原体,并且是免疫受损病人的真菌感染最常见的病原体.20世纪80年代,医院念珠菌病的发生率至少上升5倍,使之成为最常见的院内获得感染之一.尽管本病常为良性,自限性疾病,但它可能与≥40%的额外死亡率（即由于念珠菌病而不是原发疾病引起的死亡）和延长住院时间相关.
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