尽管少见，闭塞是影响肾动脉的最常见疾病。经常是因为腔壁血栓（房性心律失常，先前有心肌梗死，细菌性心内膜炎的赘生物）引起的栓塞或动脉粥样栓塞（见下文）。较少见的原因是脂肪或肿瘤栓塞。肾动脉血栓形成可继发于原有动脉粥样硬化的血管创伤后（外科手术，血管造影，血管成形术）或内膜撕裂或肾动脉瘤破裂。肾动脉的急性分割性损害（闭塞的另一原因）较主动脉少见，但较任何其他外周动脉多。原有动脉硬化疾病或纤维发育不良常易形成自发性或外伤性分割，但血管成形术已成为一个常见原因。
肾动脉主干或它的一个节段快速和完全闭塞超过2小时常引起梗塞。这是膨胀性血块栓子或完全性肾动脉血栓形成的特征性情况。梗塞典型的为楔形，从受累血管向外放射。动脉闭塞小于2小时常导致急性肾衰。动脉粥样化损害后部分闭塞缓慢形成，常位于肾动脉开口处，典型的产生肾萎缩。
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