病菌以菌丝体及分生孢子盘在病残体或土壤中越冬，次年长出分生孢子通过风雨溅散或昆虫传播，在适宜条件下分生孢子萌发长出芽管进行初次侵染。若种子带菌，播种出苗后即可引起子叶发病。初次侵染发病后可产生大量新的分生孢子，生长季只要条件适合，分生孢子通过传播后可频频进行再侵染。
高温、多雨、潮湿的天气利于此病的发生和流行，因这种天气不论对炭疽菌的生长、分生孢子的形成、传播和萌发、侵染都是有利的。栽培因素中，瓜类作物连作或邻作，病菌来源多；瓜田地势低洼排水不良、种植密度过大，田间湿度高；土壤瘦瘠、施肥不足或偏施氮肥等，都有利于诱发炭疽病。
