1.根据临床表现，结合溃疡形成、参考病因和病史大体上可作出初步诊断。
2.刮片做细菌染色、培养，有助于明确诊断。
常见细菌性角膜溃疡鉴别诊断
葡萄球菌有结膜炎史，病情发展慢先有周围边部浅层溃疡，而后中央呈多形性溃疡，前房积脓少肺炎链球菌起病急、可能有角膜外伤史，溃疡发展很快位于角膜中央部呈匐行性，有潜掘行状进展缘，呈灰黄色，前房积脓
绿脓假单胞菌有外伤异物史，溃疡发展迅速，剧痛，刺激症状重溃疡位于中央呈环形，角膜呈毛玻璃样水肿，溃疡面有黄绿色脓，前房积脓多，2～3日溃疡穿孔
淋病奈瑟菌多见于新生儿结膜水孔，角膜周边浸渍，上皮崩解，波及角膜中央，有时有前房积脓
