细菌性阴道炎的病因主要是阴道内在性乳酸杆菌大量减少，同时伴有阴道加德菌、类杆菌属变形菌届及文原体的大量增殖。
该病为混合感染，尽管有亡述病原学基础，但并非加德茵阳性者即为细菌性阴道炎，20%的正常妇女阴道涂片也可找到此菌。
寄生于阴道的细菌除自身相互制约外，其赖以生存的阴道内环境又受到各种因素的调节，与阴道菌群有关的阴道内环境包括阴道教膜上皮、阴道液、阴道内酸性环境及过氧化氢浓度等。阴道液为由各种成分组成的混合物，其中液体成分包括宫颈教液、阴道壁渗出液以及来自宫腔、输卵管与腹腔的液体，此外还有一过性的精液等，在阴道液中尚包含阴道上皮脱落细胞，寄生菌及其他产物、各种免疫活性成分，如吞噬细胞、抗体、补体及少量白细胞。影响阴道内环境的因素包括：
1.性激素生育期女性的性激素呈周期性变化，月经期前后阶段体内低雌激素水平导致阴道内pH上升，有利于许多细菌生长。妊娠期间，受体内高雌激素影响，阴道内糖原合成增加。这种高雌激素高糖环境、加上妊娠本身的免疫抑制作用有助于念珠菌生长。妊娠期阴道内过氧化氢阳性乳酸杆菌相对不足.有利于加德菌及一些厌氧菌生长。因此尽管妊娠期阴道低PH环境.同样会发生细菌性阴道炎。外源性使用激素也可以影响阴道内环境，同样会发生细菌性阴道炎。外源性使用激素也可以影响阴道内环境，如替代治疗或口服避孕药。目前通用的各种口服避孕药剂量较小，一般影响并个显著。但也有报道口服避孕药可减少细菌性阴道炎发生。
2.避孕工具各种阴道内隔膜避孕工具可查接影响阴道内环境。宫内节育器也可诱发细菌性阴道炎发生。一些杀灭精子的避孕软膏或海绵，因含有一种物质壬苯醇醚—9，对乳酸杆菌有毒性作用、使其产生过氧化氢减少，而有利于其他细菌生长。
3.性生活精液本身可改变阴道液成分而影响阴道pH。流行病学资料表明细菌性阴道炎右与其他性传摇疾病相类似的高危因素，主要发生于有性经历的妇女，而且与近期性伴侣数量显著相关。仍相反资料表明，细菌性阴道炎也发生于处女，发生率达12%。病原学研究发现细菌性阴道炎发病更可能与内源性感染有关，而与性传播关系不大。因此.目前因性生活对阴道菌群的直接影响及细菌性阴道炎是否经性传播尚未定论，有待继续研究。
4.糖尿病因患者糖代谢异常，阴道上皮细胞含糖原增加，阴道内pH下降、有利于念珠菌生长。
5.药物许多种药物影响阴道内环境，引起菌群失调，如广谱抗生素、皮质激素、抗癌药物及免疫抑制剂等。
6.感染虽然性生活本身对细菌性阴道炎直接作用不明显，但如妇女因性乱感染其他性传播疾病，如淋病、艾滋病、梅毒等，则其致病菌可直接干扰或通过作用于过氧化氢阳性乳酸杆菌，导致原有正常菌群失调。
