新生儿呕吐的原因可以是器质性（需要手术），也可以是功能性的（如幽门痉挛）。
一、幽门肥大性狭窄
幽门是胃的出口，是通往肠道的一个"关卡"。由于幽门肌肉畸形增厚、肥大、水肿，通往肠子的"关卡"只能打开得很小，使胃内的食物不能顺利进入肠道。胃壁肌肉强烈收缩，既然奶块进入肠子的阻力很大，于是就从嘴里返流出来。这样，病儿处于"饥饿"状态，势必日益消瘦。这种疾病要到外科诊治，明确诊断后通过一次简单的手术，解除幽门狭窄。婴儿吃下去的奶就能顺利进入肠道，身体得到了足够的营养，也就很快恢复健康。
要注意与幽门肥大性狭窄鉴别的另一种病叫幽门痉挛，虽有呕吐但不严重，不必手术，吃一点解痉药会慢慢自愈。
患先天性幽门肥大性狭窄的新生儿，出生后一切正常，偶然在吃奶之后吐几口奶。但是到了十天左右，呕吐次数逐日增多，吐出的奶量也越来越多。吐的动作十分剧烈，喷得很远，呕吐的声响也较大。有时吐出的奶糊沾得孩子满头满面，塞住口鼻透不过气来。呕吐物是奶液或奶凝块，不含有黄色的液体，可带有酸味，吐出的量比吃入的一顿奶要多。吐过之后孩子又哭吵着要吃，但吃奶后不多一会又恶心、呕吐。小儿越来越瘦，成了一个皮包骨头、满额皱纹的"小老头"。
二、肠梗阻（肠子不通）
新生儿时期的肠狭窄与肠闭锁引起肠子不通是严重的疾病。治疗效果的好坏在很大程度上决定于早期发现，早期诊断和早期治疗，而早期发现的关键在认识这种病的表现。
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