血管母细胞瘤可以选择两种基本的治疗方法.第一种是开刀将影响到脑或是脊髓的肿瘤切除掉.如果病患的血管母细胞瘤可以完全切除.而且在疾病分类上不是属于vonHippelLindau的话.这个病患就算是治愈了.
在一些典型囊泡状血管母细胞瘤的病患中.只有固体状肿瘤的部份是需要移除掉.至於囊泡状肿瘤的部份.则是在手术中引流出来.而且这囊泡将会在肿瘤被移除後消失.
假如血管母细胞瘤无法整个切除掉.肿瘤有可能会重新生长或是会有更多的囊泡产生.任何的脑部或是脊髓的手术都是具有侵入性的.并且有一定的风险.例如中风.感染.麻醉的并发症或是神经学上的缺损.尽管如此.透过现今的神经外科设备.大多数的血管母细胞瘤是可以安全地移除的.
相对於开脑手术.立体定位放射线手术可以用来定位和破坏血管母细胞瘤.
单一剂量的放射线手术会造成细胞逐渐死亡.然後细胞自然萎缩.在血管母细胞瘤的病患中.只有固体状肿瘤的部份是需要用放射线手术来切除的;囊状液的量会慢慢地减少产生.最後囊泡会逐渐变小.