溶栓治疗能迅速溶解血栓，明显改善临床症状，减少病死率。适用于大块栓塞，低血压、休克及伴右室功能不全的次大块肺栓塞者。近年来溶栓治疗的适应证有放宽的趋势 。溶栓时间为起病后2d内，但于2h内溶栓治疗疗效显著，因存在血栓的动态变化，对2周以上PE给予溶栓仍然有效。常用的溶栓药物有链激酶(SK)、尿激酶(UK)和组织型纤溶酶原激活剂(rt-PA) 。
通常急性肺栓塞只需1次溶栓，但溶栓后原正常肺组织新出现较大面积PE而无法介入治疗，且首次溶栓又无出血并发症时，可行2次溶栓。应在首次溶栓后第2天进行，剂量通常小于首次剂量。
