慢性细菌性前列腺炎由于症状无特异性，常需与膀胱炎、慢性尿道炎，无菌性前列腺炎和前列腺痛等相鉴别。
(一)慢性尿道炎、膀胱炎虽有尿频、尿急、尿痛等尿路症状，但前列腺指检正常，EPS镜检及培养亦正常，即前列腺无病理变化。四段培养常能定位鉴别。
(二)无菌性前列腺炎症状表现与慢性细菌性前列腺炎基本相同，但本病前列腺指检肿胀、质软，按摩后EPS易排出、量多、质稀薄、无混浊，且EPS镜检、培养均正常。
(三)前列腺痛是盆底张力性肌肉痛，临床表现为会阴部和耻骨上区疼痛或压痛，有排尿障碍等，但前列腺本身无病变，即有关前列腺的指诊及理化检查均无异常。
