有关专家说，病原菌要对人体产生不良作用，首先要能成功侵入人体，而后必需要附着于人体肠道上皮细胞粘膜，并需要适当的环境才可以滋生繁殖，到一定的数量后才会对身体造成不良影响。
益菌能够调整肠道环境，抑制有害菌在肠内的繁衍，使肠内功能正常化，促进肠道内积存的毒素排出体外。此外，当好菌占多数时，害菌就没有"作怪"的空间，害菌自然会较少。
相反地，当体内的害菌比益菌多时，就会产生毒素，加重肝脏的负荷，引发肝脏疾病;或是使肠道纤维化，引起结肠癌。
现代生活水平的不断提高，大鱼大肉的时候比以前更多，食物中的脂肪和蛋白就会过高，会造成害菌的增长。只吃肉，不吃菜，也会导致体内脂肪过多，胆固醇高等问题，引发心脏病、中风等疾病。因此，人们要多吃蔬菜，确保饮食均衡。
例如，常吃香菇就可提高人体的免疫力。它是一种高蛋白、低脂肪的营养食品。据营养学家对香菇的分析，发现香菇内有一种一般蔬菜缺乏的麦甾醇，它经太阳紫外线照射后，会转化为维生素D，这种物质被人体利用后，对于增强人体抵抗疾病的能力，起着重要的作用。科学家还发现，香菇含有蘑菇核糖核酸，它能刺激人体产生更多的干扰素，而干扰素能消灭人体内的病毒，所以多吃香菇对于预防感冒等疾病有一定帮助。现实生活也有这样的经验，常吃香菇者能抵御感冒病毒，经常吃香菇者也很少患感冒。香菇还含有一种β-葡萄糖辛酸，它能加强人体的抗癌作用和抑制肿瘤细胞的生长。因此，癌症患者在治疗期间，多吃香菇有一定的好处，而正常人多吃香菇亦能起防癌作用。香菇含有丰富的钙、磷、铁、钾等矿物元素，血清胆固醇偏高、血脂偏高、肝脏衰弱、食欲欠佳者食用香菇都有较好的保健作用。
除了保持良好的饮食习惯，人们也可以通过多吃乳酪、乳酸食品及饮料、高纤维食品，改善肠道健康。
经常服用抗生素会导致抗生素在杀灭病菌的同时，也将体内的益菌杀灭，因此常吃药的人应该多补充益菌的吸收。如：含有双叉杆菌和乳酸菌等益菌的补充剂，这些补充剂的益菌含量更集中，也更容易被人体吸收。
另外，经常运动也能够促进肠子多蠕动，帮助正常排泄，对肠道健康很有帮助。
