(一)发病原因
由于诊疗技术的进展，找到本病征病因日益增多，隐源性婴儿痉挛症(10%～15%)病因不明，无其他中枢神经系统功能失调迹象，症状性婴儿痉挛症(85%～90%)的特点是既往有脑损害体征或病因明确，生前最常见的病因(78%)是脑缺血缺氧，脑发育不全，宫内感染，脑畸形和先天代谢障碍等，生后最常见病因是感染，脑乏氧和头颅外伤，有人对71例本病患儿经检查发现异常者达73%，有脑萎 缩(49%)，先天异常(18%)，脑积水 (6%)，亦有报道系脑畸形，钙化，结节性硬化 症者20%以上发生本病，近年尚发现先天性巨细胞病毒感染 ，弓形虫感染，风疹 ，单纯疱疹 均可引起本病，国内和先祖分析本病征146例之病因，26%为原发性，余为症状性，其中包括生前因素有苯丙酮尿症 ，头小畸形，脑性瘫痪 ，唐氏综合征及头大畸形，先天脑发育不全;产时因素有宫内及产时窒息，产伤;生后因素有感染性疾病合并脑病，脑炎，脑膜炎 及脑外伤，疫苗注射等。
(二)发病机制
1.隐源性婴儿痉挛症： 指无其他可寻的病因，根据当前的知识和技术不能找到结构或生化方面的原因，随着认识的深入和诊断技术的进步，必将有越来越多的隐源性婴儿痉挛症找到脑功能或解剖结构的异常，从而阐明其病因。
2.症状性婴儿痉挛症： 由已知的脑病变引起，包括脑的器质性，结构性病变，或生化代谢紊乱等原因，可分为以下几类：
(1)脑部病变：脑发育畸形，如神经管发育障碍，脑神经元移行障碍，灰质异位，脑回畸形，脑积水等;染色体病和先天性代谢病引起的脑发育障碍;脑变性病和脱髓鞘病，如脑白质营养不良 等;神经皮肤综合征;中枢神经系统感染，如各种脑炎，脑膜炎，脑脓肿 ，先天性感染，脑囊虫病 以及其他由于病毒，细菌，原虫，寄生虫和真菌引起的感染;脑血管病，如颅内出血，血栓，栓塞，脑血管炎，动静脉畸形，动脉瘤 等;脑水肿 ，脑病，颅内压增高;脑外伤，颅脑产伤;脑瘤 ，错构瘤等。
(2)缺氧性脑损伤：引起缺氧的疾病，如心，肺疾患;窒息;休克 ;惊厥性脑损伤等。
(3)代谢紊乱：先天性代谢异常，如脑脂质沉积症，糖代谢异常，氨基酸代谢异常等;水电解质紊乱，如低钠血症 ，高钠血症 ，低钙血钙，低镁血症 等;维生素缺乏，如维生素B6依赖症;肝，肾疾患;高血压 脑病;内分泌功能紊乱。
(4)中毒：药物，金属，其他化学物质，如铅，铊，异烟肼，致惊厥药，类固醇等中毒;断药综合征，如突然停用抗惊厥药物引起的癫痫 持续状态等。