菌群失调（35%）：
由于霉菌也存在于健康人体的各个部位，当由于各种原因如大面积烧伤、急性肾功能衰竭、重症糖尿病等使机体抵抗力下降;或长期应用广谱抗生素的同时，又长期应用皮质激素，引起体内菌群失调，体内的霉菌伺机生长繁殖。
机体抵抗力降低（15%）：
长期患有慢性消耗性疾病，如白血病、糖尿病、肺结核等，降低了机体抵抗力，会发展成霉菌性尿道炎。器官移植应用免疫克服疗法，克服了免疫系统;会发展成霉菌性尿道炎。
性接触（15%）：
性接触互相传播而导致霉菌性尿道炎的发生。
医源性感染（15%）：
置入导尿管后，长期使用会发展成霉菌性尿道炎。