病因：
引发低氧血症的肝病病因：各种急，慢性肝病均可伴有肺血管异常和动脉低氧血症，最主要的是慢性肝病导致的肝硬化病人，特别是隐源性肝硬化，酒精性肝硬化，肝炎 肝硬化及原发性胆汁性肝硬化 ，也可见于慢性肝炎 ，急性重型肝炎，胆汁淤滞，ɑ-抗胰蛋白酶缺乏症 ，Wilson病，酪氨酸血症以及非肝硬化门静脉高压 如特发性门静脉高压，血吸虫性肝硬化等，肝外门静脉阻塞也可并发动脉低氧血症，对这些病人的观察提示门静脉高压可能是肝肺综合征的主要发病因素，2000年Binay等研究发现伴有高动力循环的进展性肝功能衰竭最可能发生肝肺综合征，并未发现其与肝硬化严重程度具有相关性。
病理生理
肝肺综合征的实质是肝病时发生的肺内血管扩张和动脉血氧合作用异常所致的低氧血症，动脉性低氧血症是由于血液流经肺脏时血液中的红细胞未得到充分的氧合作用或部分血液根本就没有流经肺泡进行氧合造成的，由于HPS时已排除了原发性心肺疾患，因此红细胞可能通过的异常途径有：经过胸膜和肺门支气管血管而未到达肺泡;在纵隔中血流由于压力较高的门静脉系统直接流入肺静脉，从而绕过了肺脏循环;通过扩张的肺泡毛细血管或肺动-静脉瘘直接流入肺静脉，肺泡毛细血管扩张对低氧血症的形成可能更为重要，现有研究资料显示肝肺综合征的发生至少与全身高动力状态，门静脉高压症 ，肝性脑病 ，肝肾综合征 及肺动脉高压 有关，故其发生的原因也是全身代谢及血流动力学紊乱造成的，同时又参与了全身代谢和血流动力学紊乱的形成，具有重要的病理生理意义。
(1)肝肺综合征的基本病理改变为肺血管扩张，表现为：
①大量前毛细血管扩张。
②肺基底部动-静脉交通支形成与开放。
③胸膜“蜘蛛痣 ”形成，以前毛细血管扩张为主。
在尸体解剖中人们发现肝硬化等慢性肝病患者肺部的基本病理改变是广泛的肺内。