百草枯口服后吸收快，主要蓄积在肺和肌肉中，排泄缓慢，因此毒性作用可持续存在，病变主要发生于肺，称为百草枯肺（paraquet lung），除莠剂能产生过氧化物离子（O-2）损害I型和Ⅱ型肺泡上皮细胞，引起肿胀 ，变性和坏死，抑制肺表面活性物质的产生，基本病变为增殖性细支气管炎和肺泡炎，肺的形态学变化取决于摄入后生存期的长短，在1周内死亡者，示肺充血，水肿 ，肺脏重量增加，类似于氧中毒，生存期超过1周者，肺泡渗出物（含脱落的肺泡上皮碎屑，巨噬细胞，红细胞及透明膜）机化，单核细胞浸润，出血和间质成纤维细胞增生，肺泡间质增厚，其结果发生广泛的纤维化，形成蜂窝状肺及细支气管扩张 ，百草枯中毒可引起肾小管坏死，肝中央小叶细胞损害，坏死，心肌炎 ，肺动脉中层增厚，肾上腺皮质坏死等。