化脓性门静脉炎一旦确诊，应及时处理原发病灶，可行原发感染灶切除或脓肿引流术，如肝内门静脉积脓和肝脓肿可行经皮肝穿刺引流。同时，应积极使用抗生素，其应用原则为尽早、足量、联合，以迅速控制炎症。抗生素需经静脉给药，以尽快提高血中药物有效浓度。可选用第三代或第二代头孢菌素类药，或采用氨基糖苷类与新型半合成青霉素联合应用，青霉素过敏者亦可用喹诺酮类药物。并加强全身支持治疗，厌氧菌感染时应加用甲硝唑或替硝唑。
