传统上农民肺可分为急性，亚急性和慢性三型，亚急性型多为急性延迟、发展而来，症状较重，易于误诊，但由于难以界定其时间和临床表现，且很少见，一般不必列入常规分型。
急性型：当吸入大量的嗜热放线菌孢子后约4～8h内发病，起病急骤，畏寒、高热、汗多、全身不适、食欲不振、恶心、头痛、胸闷、气短、干咳或少量黏液痰，此时极易被诊断为“感冒”，但上呼吸道症状不明显，大约有10％的患者可出现哮喘样发作，皮肤瘙痒和黏膜水肿等I型（速发型）变态反应症状，体检时可见呼吸急促，甚至缺氧，双下肺可能闻及少量湿啰音和捻发音，偶闻哮鸣音，心率加快等，脱离抗原接触后上述症状可在一天或数天内消失，有自愈趋势，如再接触抗原时可再发病。
慢性型：反复接触大量抗原者病情长期不愈，临床可见咳嗽、咳痰、呼吸困难、缺氧发绀、极度乏力，继发感染者可发烧、多汗、此时极易误诊为“慢性支气管炎”，体检可有肺间质纤维化体征或两肺散在湿啰音。
