再生障碍性贫血患者在造血干细胞移植后，有部分患者可能出现异体细胞对机体产生排斥，临床上称为移植物抗宿主病。移植物抗宿主病是异种基因造血干细胞移植过程中主要的并发症之一，临床上表现为造血干细胞移植后出现皮炎、肝炎、肠炎等一组临床征象，一般在接受异种基因造血干细胞移植后一百天内发生的称为急性移植物抗宿主病，而一百天后发生的称为慢性移植物抗宿主病。
移植物抗宿主病是由于造血干细胞与受着机体细胞除组织相容性抗原一致外，还存在免疫遗传学差异，供受者之间存在的差异就可能造成移植对宿主机体产生排斥。组织相容性抗原配型情况对移植物抗宿主病的发生有重要影响，完全不相合者移植物抗宿主病发生率为百分之百;半相合的干细胞移植，移植物抗宿主病发生率也高达70%~90%;相合者约有一半的患者发生移植物抗宿主病。
移植物抗宿主病主要损害的器官是皮肤、肠道和肝脏，发病越早的患者病情越重，其发生机制主要是由于供者的淋巴细胞对受者体内的细胞具有一定程度的攻击作用。
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