肛瘘由单纯性转化为复杂性，由肛周脓肿长久不治转化而来，可从四个不同阶段的表现中看出：
第一阶段：在初期的时候肛门局部处会受到细菌、病毒、粪便残留物的感染，出现发炎的情况，长久不治疗，炎症会逐渐向肛门四周蔓延，如阴道部、腿部、臀部等等部位。
第二阶段：肛门处炎症的发生，会使得身体抵抗力逐渐下降，使得炎症容易入侵身体各个器官中，得不到有效地控制，继续无限制蔓延。
第三阶段：炎症导致的身体抵抗力的下降，容易出现多种疾病，细菌、病毒等有害物质继续繁殖，致使肛门处血液流通不畅形成脓肿，脓肿无法消散，积聚向外扩散，使得疾病越加复杂。
第四阶段：脓肿长久得不到有效地引流，会因为内部脓液的压迫，而出现自动溃烂的性，流出厚厚的脓液，刺激肛管直肠与肛门外的皮肤组织，从而形成瘘道，脓液可以通过瘘管流出外口，导致肛瘘的产生。
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