急性、慢性的丙型病毒性肝炎病人和无症状丙型肝炎病毒携带者是丙型病毒性肝炎的传染源。
健康人感染了丙型肝炎病毒后（英文缩写成HCV），一般潜伏5-12周后发病。急性感染一般临床症状较轻或亚临床型，但此病常发展成慢性携带状态，约有40%-50%，表现为转氨酶持续升高，抗-HCV阳性，约10%-25%可发展成肝硬化。
有人通过人和动物实验证明，至少在发病前12天血液即有传染性，并可持续携带病毒6年以上，但粪便无传染性。
丙型病毒性肝炎主要是通过肠道外途径传播，包括输血、血液制品、注射器污染、器官移植，其中以输血最为常见。此外，亦可经日常生活接触传播（可能是从轻微破坏的皮肤或粘膜传播的）。
丙肝病毒的直接致病作用：丙型肝炎患者血清中HCVRNA含量和丙肝病毒抗原（HCAg）的出现与血清ALT水平呈正相关;丙肝病毒的复制常伴有肝损伤;使用干扰素治疗后，随着HCVRNA含量的减少，其血清中ALT水平也逐渐降低。从急性丙型肝炎患者肝组织病理切片上观察到广泛的肝细胞嗜酸性变，但邻近区域却相对缺乏淋巴细胞，因而推测病毒本身具有杀细胞作用。
丙型肝炎的免疫发病机理：免疫因素尤其是细胞免疫异常可能是丙肝发病的重要作用。丙型肝炎特征性病理改变（肝脏汇管区淋巴样细胞聚集或形成滤泡）也提示免疫发病机理参与丙肝病毒。
