关于克罗米酚的副作用：如果应用克罗米酚已观察到排卵，并在排卵期有性生活,但连用3-4周期仍未见受孕，应考虑暂停用药，寻找其他不孕原因，如子宫颈因素、免疫因素等。
有学者提出，在连用2个周期克罗米酚而未受孕者，可在周期第10-16日（排卵期）加用小剂量雌激素，即每日口服己烯雌酚0.25mg，以增加子宫颈粘液分泌量和改进精子的粘液穿透力，可能提高疗效.该药有一定的副作用，容易导致过剩刺激综合征，由于个体差异比较大，有的人服用时间不是很长也可能出现卵巢过度刺激，出现一些副作用，故在服用中应该注意观察病情.
凡不孕患者已患有卵巢囊肿或肝功能不良者忌用克罗米酚治疗.有作者报道在用克罗米酚的治疗中，有部分病例发生黄素化未破裂卵泡综合征.也有报道如长期或大剂量使用克罗米酚，约1%病例可造成卵巢过度刺激综合征.有学者报道发生卵巢囊性肿大者有13.6%的病例，多数病例在停药后卵巢肿大即可消失.
