直肠阴道瘘的症状比较单纯，故诊断较尿瘘容易。大的瘘孔可在阴道窥器暴露下看到或在指诊时触及；瘘孔较小者不易发见，或于阴道后壁仅见到一处鲜红的小肉芽组织，如从此处用子宫探子探查，同时另一手手指伸入肛门，手指与深针相遇则可明确诊断。如疑为小肠或结肠阴道瘘，除结合手术史分析外，可考虑钡灌肛或钡餐透视。临床表现若瘘孔较大而接近阴道口者，成形或半成形大便皆可经阴道排出，并有不能控制的排气症状，大便稀时上述症状更为严重。若瘘孔小，粪便也较干燥，则可无粪便自阴道排出，只是在便稀时方经阴道溢粪，但排气则不能控制。若粪瘘与尿瘘同时并存，则漏尿中常夹杂粪便或同时排气。阴道及外阴因常受粪便及带有粪便的分泌物刺激而发生慢性外阴皮炎。
