慢性肾盂肾炎的症状比急性肾盂肾炎期轻，有时可表现为无症状性尿。半数以上患者有急性肾盂肾炎既往史，其后有乏力、低热、厌食及腰酸腰痛等症状，并伴有尿频、尿急、尿痛等下尿路刺激症状。急性发作表现也时出现。以往将病程超过半年或1年者称为慢性肾盂肾炎，近年来提出肾盂肾盏有瘢痕形成，静脉肾盂造影见到肾盂肾盏变形、积水、肾外形不光滑，或二肾大小不等才称慢性肾盂肾炎。可有肾小管功能损害，如浓缩功能减退，低渗、低比重尿，夜尿增多及肾小管性酸中毒等。至晚期，可出现肾小球功能损害，氮质血症直至尿毒症。肾性高血压很多由慢性肾盂炎引起，一般认为患者高肾素血症及一些缩血管多肽的释放和血管硬化、狭窄等病颁有关。少数患者切除一侧病肾后，高血压得以改善。 慢性肾盂肾炎时临床表现复杂，容易反复发作，导致慢性肾盂肾炎反复发作的原因为： 1、诱发因素的存在； 2、肾盂肾盏粘膜、肾乳头部因瘢痕变形，有利于致病菌潜伏； 3、长期使用抗生素后，细菌产生了耐药性，或进入细胞内，使抗生素失去杀菌能力； 4、在体液免疫或抗生素作用下，细菌胞膜不能形成，以原浆质形式存在，在髓质渗环境下仍有生命力，故一旦环境有利，重新生长胸膜并繁殖再毒辣，此即原浆型菌株（L型）。 所以，目前为止都认为慢性肾盂肾炎是较难根治而且会逐渐进展的泌尿系疾病。
