多在感染后数年发玻主要由于血吸虫虫卵沉积于脑组织内引起的症状，临床常见的类型有以下三种：
癫痫型，多数慢性型患者属此型。血吸虫虫卵沉积于大脑皮质所致。癫痫发作的类型最常见者为部分性运动性发作（局限性癫痫）及贾克逊型发作，其次为全身性强直一阵挛发作（大发作）及部分性复合发作（精神运动性发作）。本型部分患者可伴有颅内压增高症状。
脑血管病型：急性起病，偏瘫、失语、意识障碍甚至昏迷，还可伴有部分性运动型癫痫发作。可能系血吸虫虫卵栓塞脑血管所致。需与其它原因引起的脑血管病鉴别。
颅内占位病变型：系血吸虫虫卵肉芽肿及弥漫性脑水肿所致。缓慢起病，头痛、呕吐、视力模糊、视乳头水肿、偏瘫、失语、共济失调，常伴有部分性运动型癫痫发作。脑脊液压力及蛋白含量均增高，脑脊液白细胞数正常或轻度增加，分类中嗜酸性粒细胞可占优势。
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