潜伏期10～60天，平均40天。临床表现与甲肝类似，不发展成慢性。儿童多为亚临床型感染。常见临床类型有：1.急性黄疸型占显性感染的86.5%。临床三期经历同甲肝，前驱期症状可持续到黄疸出现后第4～5天。淤胆较为常见。总病程为4～6周。2.急性无黄疸型表现与甲肝类似。3.淤胆型较为常见，病程可长达2个月以上。4.重型约占5%。高危因素包括：①妊娠妇女；②年老体弱者；③合并HBV感染。多为急性重型。5.与其他病毒混合感染（1）HEV与HAV同时或先后感染者：并不加重病情。（2）HEV与HBV重叠感染者：患者HBV常有活动性复制，HEV不易被清除。病情易迁延或反复发作。病情重，发生重型者多，印度报告80.7%的急性重型和75.5%的亚急性重型为HBsAg携带者重叠HEV感染引起。
