手术治疗的作用（1）解除胆道的梗阻，降低胰腺管内压力，利于胰液引流，去除了病因。（2）脓液的引流，减轻感染，降低炎症反应，减少炎细胞因子的释放，降低细胞因子连锁反应的强度，减轻胰腺炎的加重因素。（3）清除坏死组织。坏死组织的清除，能减少吸收反应和炎症反应，降低机体消耗，避免造成局部糜烂、溃疡引起出血。（4）止血。①应激性溃疡引起的胃肠道出血;②局部糜烂、溃疡引起的创面出血;③腹腔血管破裂出血，多见于脾动静脉、胰腺上下血管。（5）内瘘的治疗。胰腺瘘、肠瘘的治疗。对有手术指征的患者掌握好手术时机也是非常重要的环节。目前，对于重症急性胰腺炎的治疗，一般不主张早期手术，但胆源性重症急性胰腺炎特别是伴梗阻者应该早期手术，或急诊手术，这类患者应及早手术治疗的原因是解除胆道梗阻，对于胆源性胰腺炎无梗阻者则可先作非手术治疗，待病情缓解后，于出院前为患者作胆石症手术以免出院后复发。如果不及早解除胆道梗阻，胰腺坏死将会进一步发展。对于重症急性胰腺炎并发感染者，首先给予加强治疗，包括全身营养支持，针对性抗生素治疗、各重要脏器的保护等，观察24或48小时，经加强治疗病情仍有加重者，则需中转手术治疗，不能有侥幸心理，一拖再拖，迟迟不肯下手，导致严重败血症、多脏器功能衰竭而失去手术机会的恶果。
对于重症急性胰腺炎后期的腹膜后脓肿，一经发现，即刻引流。一部分患者经非手术治疗后坏死的胰腺组织或胰外侵犯的坏死组织被包裹液化，其中未感染者可逐渐自行吸收或形成胰腺假性囊肿，如该假性囊肿直径小于6厘米无症状者可暂不处理，随访观察，一旦发生感染或有增大者需及时作引流。而囊肿直径大于6厘米者伴有症状，经B超、CT扫描等检查证实不含坏死组织者，可作经皮穿刺引流，如果含有坏死组织者则需手术引流为宜。而囊肿6厘米直径大小，经3～6个月随访观察未吸收且伴有腹胀症状者，可考虑作内转流术。
对于腹膜外残余感染者，一般在第一次手术后3～4周从引流管不断溢出脓性分泌物，而伤口不愈合者，应考虑有残余感染，应该及时给予扩创，否则可造成肠瘘或创口出血等并发症，而肠瘘等反过来又影响创口不愈。
