(一)一般治疗：急性期必须卧床休息
必要时给予输液
根据病情给予流质或半流质饮食慢性患者应加强营养以增强体质
(二)病原治疗：
1
甲硝咪唑或称灭滴灵(metronidazole)：对阿米巴滋养体有较强的杀灭作用且较安全适用于肠内肠外各型的阿米巴病为目前抗阿米巴病的首选药物剂量为400～800mg口服1日3次连服5～10日;儿童为每日每公斤体重50mg分3次服连续7日服药期偶有恶心腹痛头昏心慌不需特殊处理妊娠3个月以内及哺乳妇忌用疗效达100%
2甲硝磺酰咪唑(tinidazole)：是硝基咪唑类化合物的衍生物剂量为1日2g;儿童为每日每公斤体重50mg清晨1次服连服3～5日偶有纳差腹部不适便秘腹泻恶心瘙痒等疗效与灭滴相似或更佳
3吐根碱：对组织内滋养体有有高的杀灭作用但对肠腔内阿米巴无效本药控制急性症状极有效但根治率低需要与卤化喹啉类药物等合量用药剂量按每日每公斤1mg计成人每日不超过60mg一般每次30mg1日2次深部皮下或肌肉注射连用6日
本药毒性较大治疗过程中应卧床休息每次注射前应测血压及脉搏注意心律及血压下降毒性反应有呕吐腹泻腹绞痛无力肌痛心动过速低血压心前压痛心电图异常偶有心律失常幼儿孕妇有心血管及肾脏病者禁用如需重复治疗至少隔6周
4卤化喹啉类：主要作用于肠腔内而不是组织内阿米巴滋养体对轻型排包囊者有效对重型或慢性患者常与吐根碱或灭滴灵联合应用碘仿溶液100～150ml作保留灌肠主要副作用为腹泻偶有恶心呕吐和腹部不适对碘过敏和有甲状腺病者忌用
5其他：安特酰胺口服0.5g1日3次连续10日;巴龙霉素每日每公斤体重15～20mg分次口服5～7日;安痢平口服0.1g1日3次连服10日以上3药都作用于肠腔内阿米巴
6中草药：鸦胆子取仁15～20粒装胶囊内口服1日3次连续7日;大蒜1日6g分次生吃连续10日;白头翁15～20g制成煎剂分3次服连续10日
以上各种药物除灭滴灵外往往需要2种或2种以上药物的联合应用方能获得较好效果
(三)并发症的治疗：在积极有效的灭滴灵工吐根碱治疗下一切肠道并发症可得到缓解暴发型患者有细菌混合感染应加用抗生素大量肠出血可输血肠穿孔腹膜炎等必须手术治疗者应在灭滴灵和抗生素治疗下进行
肠阿米巴病若及时治疗预后良好如并发肠出血肠穿孔和弥漫性腹膜炎以及有肝肺脑部转移性脓肿者则预后较差治疗后粪检原虫应持续半年左右以便及早发现可能的复发
